Djelatnici Instituta nositelji su brojnih samostalno uobličenih, inovativnih i istraživački poduprtih kolegija. Sudjelovanje u nastavi ujedno podrazumijeva i organizaciju studija dodiplomske i poslijediplomske nastave. Dugogodišnja suradnja ostvaruje se s brojnim odsjecima Filozofskog fakulteta u Zagrebu (Odsjek za kroatistiku, Odsjek za komparativnu književnost, Odsjek za sociologiju i dr.), a naspose s Odsjekom za etnologiju i kulturnu antropologiju Filozofskog fakulteta u Zagrebu na kojem su za osmišljavanje i provođenje doktorskog studija djelatnici Instituta zaslužni od njegovog začetka. Ta suradnja se upotpunjava na dodiplomskom studiju izvedbom obveznog folklorističkog kolegija i jedinstvenog folklorističkog modula na diplomskom studiju gdje su predavači redom zaposlenici Instituta. Dugogodišnja suradnja u nastavi ostvaruje se i s Muzičkom akademijom Sveučilišta u Zagrebu. Institut je oduvijek temeljna obrazovna ustanova hrvatskih etnomuzikologa, a etnomuzikolozi iz Instituta jedini su predavači etnomuzikoloških predmeta na Sveučilištu u Zagrebu. Rezultat također dugogodišnje suradnje s Hrvatskim studijima jest i prijedlog cjelokupnog programa studija kulturne antropologije koji dosad nije realiziran zbog infrastrukturnih i financijskih prepreka. Suradnja se ostvaruje i s nastavom na Akademiji dramske umjetnosti i Fakultetu političkih znanosti Sveučilišta u Zagrebu, na Odjelu za etnologiju i kulturnu antropologiju Sveučilišta u Zadru, na Odsjeku za kazališnu umjetnost Umjetničke akademije Sveučilišta u Osijeku, na Kulturalnim studijima Filozofskog fakulteta u Rijeci te na Odjelu za restauraciju i konzervaciju Sveučilišta u Dubrovniku.
Izvedbom kolegija, predavanjima i mentorstvima nastavlja se i dugogodišnja međunarodna suradnja u studiju etnomuzikologije na Muzičkoj akademiji u Sarajevu (BiH); s Fakultetom za podiplomski humanistični študij Ljubljana (ISH), Fakultetom za podiplomski študij Nova Gorica, Filozofskim fakultetom Sveučilišta u Mariboru (Slovenija). Uspostavljena je suradnja s Istituto Universitario Suor Orsola Benincasa, Sveučilišta u Napulju, te sa Sveučilištem u Udinama (Italija) s kojim se uz suradnju Centra za ženske studije organiziraju specijalistički feministički poslijediplomski seminari pri Interuniverzitetskom centru u Dubrovniku.
Kolegiji predavača s IEF-a